Jste zde

F7PMITBA-S - Tvorba biomedicínských aplikací

Kód	Zakončení	Kredity	Rozsah	Jazyk výuky
F7PMITBA-S	Z,ZK	6	1P+3C	česky

Garant předmětu:

Radim Krupička

Přednášející:

Bohuslav Dvorský, Radim Krupička

Cvičící:

Bohuslav Dvorský, Radim Krupička

Předmět zajišťuje:

katedra biomedicínské informatiky

Anotace:

Předmět se zabývá konkrétními implementacemi biomedicínských aplikací, jejich standardy, knihovnami a doporučenými postupy pro jejich tvorbu. V předmětu se popíšou specifika informačních systémů pro zdravotnictví, implementace komunikace zdravotnického software pomocí standardů a tvorba aplikací pro podporu výzkumu a zpracování biomedicínských dat.

Požadavky:

Podmínky udělení zápočtu: povinná účast na cvičení (max. 2 omluvené absence). Během semestru studenti absolvují 2 praktické testy na cvičení i s teoretickými otázkami (zisk až 50 bodů/test). Známka se udělí podle celkového zisku bodů podle stupnice ECTS.

Osnova přednášek:

Témata přednášek a cvičení:

1.Git, týmová práce, projekt, metodiky vývoje software.

2. Knihovny pro zpracování signálu a obrazu a zobrazení

3.Datové medicínské informační zdroje - restapi

4. Devops - git pipepline a continue integragration

3.Informační systémy ve zdrovotnictví - vývoj a specifika

4.Bioinformatické aplikace - zpracování DNA sekvencí v klinické praxi

5.Bioinformatické aplikace ve výzkumu

6.Vývoj aplikací pro docker

Osnova cvičení:

Na cvičení studenti budou vyvíjet konkrétně aplikace se zaměřením na biomedicínu. Při vývoji budou používat knihovny pro práci se standardy a biomedicínskými daty. Studenti vytvoří formou zápočtové úlohy biomedicínskou aplikaci. Zaměření aplikace bude vybráno během prvních cvičení. Na konci semestru bude aplikace zkontrolována, okomentována a ohodnocena vyučujícím.

Cíle studia:

Studijní materiály: