Kód | Zakončení | Kredity | Rozsah | Jazyk výuky |
---|---|---|---|---|
F7PMITBA-S | Z,ZK | 6 | 1P+3C | česky |
Předmět se zabývá konkrétními implementacemi biomedicínských aplikací, jejich standardy, knihovnami a doporučenými postupy pro jejich tvorbu. V předmětu se popíšou specifika informačních systémů pro zdravotnictví, implementace komunikace zdravotnického software pomocí standardů a tvorba aplikací pro podporu výzkumu a zpracování biomedicínských dat.
Podmínky udělení zápočtu: povinná účast na cvičení (max. 2 omluvené absence). Vytvoření a odprezentování biomedicínské aplikace splňující požadavky mikroservisní architektury, její kontejnerizace a nasazení v klastru. (aplikace a prezentace celkem 20 bodů)
Zkouška: Bez získání zápočtu jeho zápisu do KOSu není možné realizovat zkoušku. Během semestru studenti absolvují 2 praktické testy na cvičení (zisk až 40 bodů/test). Známka se udělí podle celkového zisku bodů ( 20 +2*(40) ) podle stupnice ECTS.
Témata přednášek:
1.Datové medicínské informační zdroje - restapi
2.DevOps - git, continuous integration
3.Informační systémy ve zdrovotnictví - vývoj a specifika
4.Bioinformatické aplikace - zpracování DNA sekvencí v klinické praxi
5.Bioinformatické aplikace ve výzkumu
6.Vývoj aplikací pro docker
7.Knihovny pro počítačové učení, zpracování signálu a obrazu
Na cvičení studenti budou vyvíjet konkrétně aplikace se zaměřením na biomedicínu. Při vývoji budou používat knihovny pro práci se standardy a biomedicínskými daty. Studenti vytvoří formou zápočtové úlohy biomedicínskou aplikaci. Zaměření aplikace bude vybráno během prvních cvičení. Na konci semestru bude aplikace zkontrolována, okomentována a ohodnocena vyučujícím.
Povinná literatura:
[1] STŘEDA, Leoš a Karel HÁNA. EHealth a telemedicína: učebnice pro vysoké školy. Praha: Grada Publishing, 2016. ISBN 978-80-247-5764-3.
[2] MÜNZ, Jan. Informační technologie ve zdravotnictví: informační systémy. V Praze: České vysoké učení technické, 2011. ISBN 9788001047200.
Doporučená literatura:
[3] Dokumentace HL7: www.hl7.org
[4] Dokumentace k DICOM: dicom.nema.org