F7PMLFG - Forenzní genetika

Cílem nabízeného předmětu je seznámit studenta s oblastí molekulární genetiky, která se pohybuje nejen na rozhraní biomedicíny, práva a spravedlnosti, ale také v oblasti obrany a hospodářské kriminality. Představení základních etap přípravy genetického profilu jedince, tj. části biologické (protokolární sběr biologického materiálu, práce s bioinformatickými databázemi a zpracování biologického materiálu pomocí nejrůznějších specializovaných extrakčních technik), dále části technologické (vlastní manipulace s extrahovanou nukleovou kyselinou, amplifikace klíčových jedinečných míst lidského genomu a fragmentační analýza amplifikovaného biologického materiálu) a části genetické (vyhodnocení, zpracování a porovnání získaných genetických profilů, zásady přípravy znaleckého posudku, interpretace získaných genetických dat a obhájení závěrů před soudem) je hlavním úkolem této přednášky. Student by měl být seznámen v průběhu této přednášky se všemi aspekty forenzně genetického testování pro soudní lékařství, kriminalistiku a další příbuzné obory.

Forma ověření studijních výsledků: dva zápočtové testy s více volbami v průběhu semestru (20 otázek) z přednesených témat a témat řešených v laboratorní praxi, součet bodů z obou testů 100 a více (z 150 možných), je přípustný pouze jeden pokus na splnění každého testu, neúčast na určeném termínu omlouvají pouze závažné zdravotní komplikace doložené lékařským potvrzením. Ústní zkouška k předmětu bude probíhat formou vylosovaných otázek, z nichž jedna bude teoretická a jedna bude praktická.

Požadavky na studenta: 100 % účast na laboratorní praxi, neúčast bude řešena seminární prací na téma vybrané z literatury, namátkové kontroly znalostí během laboratorní praxe.

Témata přednášek:

1.Forenzní genetika základ identifikační biologie.

2.Zdroje biologického materiálu a extrakce DNA z různých typů tkání.

3.Kvantifikace DNA a principy dalších diferenciačních testů.

4.Hybridizace, VNTR typizace a další použitelné směry identifikace.

5.STR (Short Tandem Repeats) profilování.

6.Analýza mitochondriální DNA.

7.Obecně genetické aspekty výběru a odečítání polymorfních míst.

8.Určování pohlaví a možnosti dalších forenzně genetických testů.

9.Populační genetika pro forenzní účely.

10.Forenzní DNA laboratoř a podstata Národní databáze DNA.

11.Forenzně genetické analýzy degradované a historické tkáně (biomolekulární archeologie, paleogenetika).

12.Možnosti čipové analýzy a bioinformatických přístupů ve forenzní praxi. Interpretace výsledků forenzně genetické analýzy pro orgány činné v trestním řízení a soudy znalecký posudek. Genetika jako součást systému forenzních a kriminalistických věd.

Témata laboratorních cvičení:

Laboratorní cvičení proběhnou blokově a budou zaměřena na tyto oblasti:

Laboratorní praxe I: 1 protokol k izolaci DNA ze slin.

Laboratorní praxe II: 2 protokoly k přípravě individuálního genetického profilu.

Laboratorní praxe III: 2 protokoly k vyloučení a potvrzení otcovství ze získaného individuálního genetického profilu.

Povinná literatura:

BRIGHT Jo-Anne a Michael COBLE. Forensic DNA Profiling. A practical Guide to Assigning Likelihood Ratios. CRC Press. 2021. ISBN 9781032082318.

GUNN, Allan. Essential Forensic Biology. 3rd Edition. Wiley, 2019. ISBN 9781119141402.

Doporučená literatura:

AMORIM Antonio. Handbook of Forensic Genetics: Biodiversity and Heredity in Civil and Criminal Investigation. World Scientific Publishing UK Ltd, 2016. ISBN 97817863407711.

TAUPIN Jane Moira. Interpreting Complex Forensic DNA Evidence. CRC Press. 2019. ISBN 9781138495678.

GILL Peter, BLEKA Oyvind, HANSSON Oskar, BENSCHOP Corina and Hinda HANED. Forensic Practitioner's Guide to the Interpretation of Complex DNA Profiles. 1st Edition Academic Press, Ltd. 2020. ISBN 9780128205624.

ELKINS, Kelly M. Next Generation Sequencing in Forensic Science. Taylor & Francis Ltd. 2021. ISBN 9781032072043.

PILLI Elena and Andrea BERTI. Forensic DNA Analysis, Technological Development and Innovative Applications. Apple Academic Press. 2021.

• Navazující magisterský studijní program Biomedicínské laboratorní metody (povinný předmět)